Электронная библиотека диссертаций и авторефератов России
dslib.net
Библиотека диссертаций
Навигация
Каталог диссертаций России
Англоязычные диссертации
Диссертации бесплатно
Предстоящие защиты
Рецензии на автореферат
Отчисления авторам
Мой кабинет
Заказы: забрать, оплатить
Мой личный счет
Мой профиль
Мой авторский профиль
Подписки на рассылки



расширенный поиск

Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Воропаева, Елена Александровна

Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека
<
Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека
>

Диссертация - 480 руб., доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Автореферат - бесплатно, доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Воропаева, Елена Александровна. Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека : диссертация ... доктора биологических наук : 03.02.03 / Воропаева Елена Александровна; [Место защиты: ФГУН "Московский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии"].- Москва, 2013.- 352 с.: ил.

Содержание к диссертации

Введение

Глава 1. Обзор литературы 28

1.1 .Микробиоценозы открытых полостей 28

1.1.1 .Общие положения 28

1.1 .Колонизационная резистентность 31

1.1.3.Биоплёнка 37

1.1.4. Показатели состояния микробиоценозов - показатели реактивности макроорганизма 41

1.1.5.Микробиоценоз кожи 46

1.1 .б.Микробиоценоз ротоглотки 48

1.1.7.Микробиоценоз кишечника 51

1.1.8.Микробиоценоз влагалища и цервикального канала 65

1.1.9.Микробиоценоз уретры 81

1.2.Заболевания верхних дыхательных путей у детей 83

І.З.Патогенетические особенности микрофлоры при пародонтитах 86

1,4.Хламидиозы 87

1.4.1 .Урогенитальный хламидиоз 87

1.4.2.Патогенетическая роль СМ. pneumoniae 105

1.5.Этиологическая роль уреаплазм в возникновении и развитии воспалительных процессов гениталий 108

І.б.Роль микробиоценозов влагалища, кишечника и ротоглотки при невынашивании беременности 117

1.7.Патогенетическая роль микроорганизмов при перитонитах 119

1.8. Роль врождённого иммунитета в инфекционной патологии 121

1.8.1 .Характеристика рецепторов врождённого иммунитета 121

1.8.2.Видовая специфичность TLR 126

1.8.3.Экспрессия TLR на клетках и в тканях человека 128

1.8.4.Активация TLR 132

1.8.5.Молекулярные механизмы взаимодействия TLR с клетками макроорганизма 134

1.8.6.Роль TLR в патогенезе инфекционных заболеваний и инициации местной антиинфекционной резистентности 139

Глава 2. Материалы и методы исследования 145

2.1.Клинико-лабораторная характеристика обследованных пациентов... 145

2.1.1. Клинико-лабораторная характеристика детей с инфекционной патологией респираторного тракта 145

2.1.2. Клинико-лабораторная характеристика больных пародонтозом 145

2.1.3. Клинико-лабораторная характеристика женщин с диагностированной уреаплазменной инфекцией урогенитального тракта 146

2.1.4. Клинико-лабораторная характеристика женщин с диагностированным или перенесенным урогенитальным хламидиозом (УГХ) урогенитального тракта 147

2.1.5. Клинико-лабораторная характеристика клинически здоровых женщин контрольной группы 149

2.1 .б.Клинико-лабораторная характеристика беременных 150

2.1.7.Клинико-лабораторная характеристика пациентов с распространённым гнойным перитонитом 150

2.1.8. Клинико-лабораторная характеристика низших приматов с установленной спонтанной хламидийной инфекцией 151

2.2. Клинико-лабораторные методы исследования 151

2.2.1.Микроскопическое исследование мазков со слизистых УГТ 153

2.2.2.Оценка функционального потенциала мукозальной защиты 153

2.2.3.Микробиологические исследования 153

2.2.4.Молекулярно-генетические методы исследования 160

2.2.5.Цитологический метод диагностики хламидийной инфекции 164

2.2.6.Серологический метод диагностики хламидийной инфекции 165

2.2.7.Культуральный метод (диагностика хламидиоза) 165

2.2.8.Иммунологические методы исследования 165

2.2.9.Количественное определение содержания альбумина и общего белка в слюне 167

2.2.10.Определение активности лизоцима в слюне 167

2.2.11 .Гормональные исследования 167

2.2.12.Статистическая обработка полученных данных 167

Глава 3. Колонизационная резистентность слизистых открытых полостей как объективный показатель реактивности организма и интегральный показатель состояния их микробиоценозов 168

3.1. Состояние микробиоценоза ротоглотки при респираторной патологии как индикатор инфекционной резистентности детей 168

3.2.Микробиоценоз ротоглотки при бронхитах у детей 173

З.З.Патогенетические особенности микробного пейзажа при пародонтите 183

3.4.Микробиоценоз влагалища при уреаплазмозе 184

3.4.1.Диагностическая значимость изменения чувствительности микроорганизмов к антибактериальным и фунгицидным препаратам 199

3.5. Микробиоценоз влагалища и цервикального канала при урогенитальной хламидийной инфекции 201

3.5.1.Колонизационная резистентность слизистых цервикального канала как интегрирующая составляющая местного иммунитета 213

З.б.Микробиотопы влагалища и цервикального канала и их патогенетическая роль при уреаплазмозе и хламидиозе 220

3.7.Состояние микробиоценозов влагалища, ротоглотки и кишечника при невынашивании беременности 228

3.7.1 .Микробиоценоз влагалища 228

3.7.2.Микробиоценоз ротоглотки 239

3.7.3 .Микробиоценоз кишечника 247

3.7.4.Особенности микроэкологии влагалища, полости рта и кишечника у беременных с инфекционным, гормональным и смешанным генезом невынашивания в ранние сроки гестации 255

3.7.5.Индивидуальный анализ состояния, взаимосвязи и взаимозависимости микробиоценозов влагалища, полости рта и кишечника у беременных 261

3.8.Микробиологическая характеристика распространенного гнойного перитонита 262

3.8.1.Микробиологическая оценка эффективности бактериофаготерапии 269

3.8.2.Островки патогенности как дополнительный критерий оценки вирулентности штаммов микроорганизмов 274

Глава 4.Связь генотипических и фенотипических свойств возбудителя с клиническими проявлениями при хламидиозе обезьян 279

4.1.Взаимодействие факторов патогенности хламидии плазмиды и гена IncA 282

4.2. Выявление чувствительности к антибиотикам 285

4.3.Роль генотипирования штаммов Ch. trachomatis в прогнозировании их патогенности 286

Заключение 288

Алгоритм функционирования колонизационной резистентности слизистых открытых полостей 325

Выводы 326

Практические рекомендации 328

Список литературы

Введение к работе

Актуальность проблемы

Микрофлора организма человека, является основой его микроэкологии и оказывает непосредственное влияние на жизнедеятельность, состояние здоровья и, как следствие, качество жизни. Микробиоценоз - динамическая микроэкологическая система, способствующая созданию более или менее однородных оптимальных условий для нормальной жизнедеятельности аутофлоры и выполняющая или регулирующая многочисленные функции макроорганизма.

Показатели состояния микробиоценозов отражают состояние реактивности макроорганизма - способности организма отвечать на воздействия внешней среды изменением своей жизнедеятельности, что обеспечивает его адаптацию к различным условиям обитания. Слизистые открытых полостей макроорганизма представляют собой единую систему. Их барьерная функция определяется состоянием колонизационной резистености (КР) - способностью микрофлоры и макроорганизма в кооперации защищать экосистему слизистых от патогенов (Иммунобиологические препараты, перспективы применения в инфектологии, Г.Г. Онищенко, В.А. Алёшкин, С.С. Афанасьев, В.В. Поспелова (ред.), 2002; Бондаренко В.М., Мацулевич Т.В., 2007; Кочеровец В.И., Бунятян Н.Д., 2011).

Таким образом, КР является важной составляющей системы антиинфекционной резистености организма человека, которая определяется качественным и количественным составом биопленки, формируемой индигенной микрофлорой и/или патогенными микроорганизмами, а также факторами местной и организменной иммунной защиты. В настоящее время накоплено достаточно большое количество информации о роли качественных и количественных изменений микрофлоры открытых полостей организма человека в развитии инфекционно-воспалительных процессов и ряда соматических заболеваний.

Так, начало большинства бронхолегочных заболеваний связано с развитием патологических процессов в слизистой оболочке верхних дыхательных путей и ротоглотке, которая в норме задерживает и элиминирует около 70% поступающего извне инертного и агрессивного антигенного материала. Инициация любого инфекционно-воспалительного процесса зависит от соотношения уровней индигенных и условно-патогенных микроорганизмов, формирующих данный биотоп (Самсыгина Г.А., 2008; El Feghaly R.E. et al., 2010).

Количественные и качественные нарушения в составе микробных симбионтов десневой жидкости, нарушения их взаимодействия с макроорганизмом обуславливают развитие пародонтита (Козлов Л.В. и др., 2008).

Возбудители урогенитального хламидиоза и уреаплазмоза - облигатные внутриклеточные паразиты, не относятся к патогенам, представляющим особую опасность, но на фоне растущей урбанизации, ухудшения социально-демографической и экологической ситуации инфицирование ими способно приводить к различным осложнениям, оказывающим неблагоприятное влияние как на общее состояние здоровья, так и на репродуктивную функцию населения. Их патогенный потенциал определяется концентрацией в организме, наличием или отсутствием определённых генов патогенности, состоянием микробиоценоза биотопа (лимитирующим фактором выступают условно-патогенные микроорганизмы и комменсалы, усиливающие патогенетический потенциал инфекционных агентов), ассоциацией с другими патогенными бактериями и вирусами, изменением физиологического и иммунного статуса, соматическими заболеваниями (Фидров А.А. и др., 2006; Donatella et al., 2008).

При физиологическом течении беременности большое внимание уделяется нормальному микробиоценозу различных биотопов организма (влагалище, ротоглотка, кишечник). Различные экзогенные и эндогенные факторы вызывают изменение гомеостаза, развитие дисбактериозов, и, как следствие, нарушение нормального течения гестационного процесса (Шварцман Я.С., Хазенсон Л.Б., 1978; Кира Е. Ф., 2001; Тютюнник В.А., 2003) .

Одним из самых насущных вопросов современной хирургии является перитонит, его классификация, оценка тяжести и лечение. При перитоните, как правило, выявляется полимикробный характер инфицирования. Оценка микробного пейзажа желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) позволяет выявить источник и характеризовать возбудителей при перитоните, судить об эффективности антибактериальной терапии (Войно-Ясенецкий В.Ф., 2006; Мороз В.В. и др., 2006). Каждый конкретный стационар характеризуется своим микробным пейзажем и госпитальными штаммами. Практически все нозокомиальные штаммы – представители микрофлоры желудочно-кишечного тракта человека (Alberti C. et al., 2002) .

К сожалению, большинство микроэкологических исследований проводились без учета факторов местной и организменной резистентности. Вместе с тем, формирование КР слизистых оболочек, баланс воспалительно-противоспалительных реакций респираторного, урогенитального и желудочно-кишечного трактов определяется как индигенной микрофлорой, так и факторами местной иммунной защиты. Ключевым звеном КР является система врожденного иммунитета, в частности, TL-рецепторы мембранных комплексов, экспрессирующиеся в большинстве клеток организма человека. Антиинфекционная защита на местном уровне развивается путем формирования типичной воспалительной реакции при взаимодействии патогенов с TL-рецепторами и сопровождается активацией генов цитокинового каскада, ответственного за активацию фагоцитов и других иммунокомпетентных клеток, иммуноглобулинов (Ig), что, в свою очередь, определяет уровень мукозальной КР и, в дальнейшем, блокирование жизнедеятельности, дезинтеграцию и удаление инфекционного агента из организма (Spitzer J.H. et al., 2002; Liew F.Y. et al., 2005).

В связи с вышесказанным, представляется актуальным исследование взаимосвязи характеристик микробиоценозов и факторов врожденного и приобретенного иммунитета слизистых открытых полостей человека в норме и при инфекционной патологии.

Цель исследования - установление роли микробиоценозов респираторного, урогенитального и желудочно-кишечного трактов в формировании реактивности и антиинфекционной резистентности организма и оценка влияния дисбиотических нарушений на выраженность клинических проявлений инфекционно-воспалительных процессов при различных нозологических формах заболеваний.

Задачи исследования

  1. Определить особенности формирования микробиоценоза слизистых дыхатель-

ных путей и факторов местного иммунитета у клинически здоровых детей и при респираторной патологии: острых респираторных вирусных инфекциях, тонзиллитах, ангинах, бронхитах, пневмониях.

  1. Оценить качественный и количественный состав микрофлоры просветной и

пристеночной областей и показатели местного иммунитета биотопа урогенитального тракта у клинически здоровых женщин репродуктивного возраста, и женщин, больных уреаплазменной и хламидийной инфекциями. Выявить влияние инфицированности хламидиями и уреаплазмами на восприимчивость макроорганизма к гетерологичным возбудителям инфекций.

  1. Оценить антибиотикорезистентность как фактор патогенности внутриклеточ-

ных возбудителей патогенных и условно-патогенных микроорганизмов при уреаплазмозе, хламидиозе и распространённом гнойном перитоните в динамике при наблюдении пациентов.

  1. Отработать подходы к оценке видовой и штаммовой вирулентности возбудите-

лей уреаплазмоза, хламидиоза и гнойного перитонита по выявлению у них генетических детерминант патогенности и антибиотикорезистентности. Обосновать целесообразность применения комплексных фаговых препаратов при санации брюшной полости при перитонитах

  1. Изучить состояние пристеночного и просветного микробиоценоза слизистых

влагалища, ротоглотки, кишечника и факторов местного иммунитета как критериев состояния здоровья у клинически здоровых беременных и женщин при невынашивании беременности. Проанализировать взаимосвязь выраженности нарушений указанных микробиоценозов при данной патологии.

  1. На основании проведенных комплексных исследований выявить патогенети-

ческий, диагностический и прогностический потенциалы микробиоценозов биотопов открытых полостей и их взаимосвязь с показателями местного иммунитета.

  1. Разработать алгоритм оценки функционального состояния колонизационной

резистентности слизистых респираторного, урогенитального и желудочно-кишечного тракта при инфекционно-воспалительных процессах различной локализации.

Научная новизна работы

Проведённые исследования позволяют представить микробиоценозы открытых полостей макроорганизма как динамические микроэкологические системы, формируемые микрофлорой (совокупностью типичных для определенного биологического вида и конкретного биотопа ассоциаций микроорганизмов), иммунологическими факторами антиинфекционной защиты макроорганизма и воздействием окружающей среды. Биотопы открытых полостей характеризуются единством и способностью к саморегуляции, являются интегральной частью организма хозяина и местного иммунитета, в частности. Колонизационная резистеность является показателем состояния микробиоценоза биотопа и местной антиинфекционной резистености.

При респираторных заболеваниях у детей родовой и видовой состав микроорганизмов, выделенных от больных, может служить дополнительным объективным критерием тяжести течения инфекционного процесса, а также позволяет дифференцированно судить об эффективности проводимой антибактериальной терапии и вносить необходимые коррекции в неё.

При остром и хроническом бронхитах у детей ведущими этиологическими факторами инфекционного процесса являются ассоциации вирусных и бактериальных патогенов и условно-патогенных микроорганизмов (УПМ). При остром бронхите нарушения сдвигаются в сторону дисбиоза и выраженного воспалительного процесса, сопровождающимися высокими уровнями как индигенной микрофлоры, так и УПМ, что свидельствует о выраженной КР. При хроническом бронхите не резко выраженное повышение перечисленных показателей свидетельствует о вяло текущем процессе. Обратная зависимость между показателями естественной и искусственной адгезий клеток буккального и назофаррингиального эпителиев свидетельствует о нарушении реакции рецепторов клеток эпителия на микроорганизмы и способствует преодолению микрофлорой колонизационного барьера. Взаимодействие TLR-2, TLR-4, TLR-3, TLR-8 с микрофлорой биотопа определяет колонизационную резистеность слизистых. Подтверждено, что при респираторной патологии у детей TLR-2 и TLR-4 реагируют преимущественно на бактериальные патогены, а TLR-3 и TLR-8 - на вирусные. Установлена достоверная взаимосвязь TLR с факторами врождённого иммунитета лизоцимом, индексом естественной колонизации назофарингиального эпителия (ИЕКНЭ), sIgА и sc. Уровни IgЕ независимы от показателей экспрессии генов TLR.

Выявлена способность микрофлоры десневой жидкости больных паро-донтозом продуцировать протеиназы, обладающие неспецифической и специ-фической (по гидролизу исключительно IgA1 человека) активностями.

Впервые комплексно оценена просветная и пристеночная микрофлора и показатели Ig секрета влагалища (Вл) клинически здоровых женщин и пациенток с уреаплазменной микст-инфекцией. Выявлено резкое снижение КР, характеризующееся появлением и/или значительным увеличением в просветной и пристеночной областях ассоциаций условно-патогенных факультативно- (стрептококки, стафилококки, энтерококки, энтеробактерии, кандида) - и облигатно-анаэробных микроорганизмов (пептострептококки, пептококки, гарднереллы, бактероиды, фузобактерии) и изменением показателей уровней Ig секрета Вл. Оценка содержания УПМ различной таксономической принадлежности в сопоставлении с уровнями Ig секретов позволяет оценивать степень дисбиотических нарушений микробиоценоза Вл. УПМ и грибы рода Candida обладают высокой резистентностью к антибактериальным и фунгицидным препаратам, изменяющейся в процессе лечения и отражающей его эффективность. При совместном применении иммуномодуляторов и антибактериальных препаратов повышается элиминирующий эффект последних на возбудителей и задерживается селекция антибиотикорезистентных культур в процессе лечения.

При урогенитальном хламидиозе (УГХ) патогены и УПМ, попадая на слизистые урогенитального тракта (УГТ), взаимодействуют с TLR и запускают воспалительную реакцию. Различные уровни активации TLR-2 и TLR-4 зависят от качественного состава микробных сообществ, присутствующих на слизистой оболочке УГТ. Показатели уровней обсеменённости УПМ цервикального канала (Цк), уретры (Ур) и влагалища (Вл) прямо коррелируют с показателями уровней экспрессии генов TLR-2 и TLR-4. Повышение экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 в Цк и в Ур, коррелирует с тяжестью клинических проявлений. Во Вл имеет место экспрессия генов TLR-2 и TLR-4 в ответ на УПМ, а в Цк и Ур - на УПМ и возбудителей инфекций, передаваемых половым путем (ИППП). Активация экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 происходит более выраженно в ответ на патогены и УПМ и менее выражено - на нормофлору.

Естественная или приобретённая супрессия генов TLR-2 и TLR-4 обус-лавливает хроническое течение УГХ. Однотипные изменения показателей экс-прессии генов TLR-2 и TLR-4 в Цк и Ур при хроническом УГХ указывают на "феномен рецепторной депрессии", сопровождающегося дисбалансом между развитием инфекционного процесса и воспалительной реакцией. Уровни экспрессии генов TLR-2 и TLR-4 служат критериями оценки выраженности УГХ и воспалительного процесса, а при выздоровлении их снижение свидетельствует об эрадикации возбудителя. При остром УГХ выявление низких уровней TLR-2 и TLR-4 указывает на начало хронизации инфекционного процесса.

Впервые показано, что неотъемлемой частью патологических проявлений при урогенитальном хламидиозе и уреаплазе на организменном и местном уровнях является повышенная восприимчивость к гетерологичным бактериальным и вирусным патогенам.

При невынашивании беременности одновременное достоверное увеличение числа ассоциаций и интенсивности колонизации УПМ, снижение IgG, IgA, IgM, IgA, sIgA и sc во влагалище (ВЛ), полости рта и кишечнике свидетельствует о риске невынашивания беременности и служит объективным критерием состояния реактивности организма и качества жизни пациенток, имеет диагностический и прогностический характер. Наличие тесной связи между микробиоценозами Вл, полости рта и кишечника служит обоснованием необходимости проведения комплексного исследования и своевременной коррекции выявленных нарушений, что может свести к минимуму вероятность невынашивания беременности. Инфекционный, гормональный или смешанный генез невынашивания беременности определяет выраженность изменений микробиоценозов Вл, полости рта и кишечника. Высокая частота и степень выраженности дисбиотических нарушений и наличие тесной связи между биотопами свидетельствует о системных микроэкологических изменениях в организме беременной.

Микробиологическая характеристика желудочно-кишечного тракта пациентов с гнойными перитонитами позволяет объективизировать оценку тяжести течения, стадии развития патологического процесса, оценку патогенетических свойств микроорганизмов по выраженности у них антибиотикорезистентности и их устойчивости к антисептическим препаратам. Выявлен пятилетний период четкой смены основного возбудителя нозокомиального инфицирования брюшной полости. Установлен 2-3-летний период в появлении устойчивых штаммов к антисептическим растворам, применяемым для этапных санаций брюшной полости. Степени антибиотикорезистетности, фагорезистетности и устойчивости к антисептическим растворам выделенных штаммов при перитонитах - дополнительные критерии их патогенности. Отсутствует корреляция между антибиотико- и фагоустойчивостью. Впервые применённая при лечении перитонитов бактериофаготерапия исключает присоединение внутрибольничной флоры и обеспечивает элиминацию из перитониальной полости микроорганизмов, устойчивых к использованным ранее антибактериальным препаратам. Терапевтическая эффективность фагового препарата повышается при подборе фагов к конкретному микроорганизму, выделенному от конкретного пациента.

Нозокомиальные штаммы E. coli, Acinetobacter и псевдомонадных бактерий от больных с перитонитом высеваются в титре 106 lg КОЕ/г, что косвенно свидетельствует о приобретении ими патогенных свойств. Нозокомиальные штаммы обладают генами, отвечающими за адгезию бактериальных клеток к тканям макроорганизма, обеспечивающими размножение, антибиотикорезистентность и повышающими патогенность бактерий. Выявление островков патогенности (ОП), определяющих антибиотикорезистентность, в большинстве случаев совпадает с частотой выявления антибиотикорезистености диско-диффузионным методом. Тем не менее, выявление ОП, определяющих антибиотикорезистентность, у 30% штаммов не совпадает с частотой выявления антибиотикорезистентности in vitro, что свидетельствует о многоплановых генетических механизмах, её определяющих.

Впервые предложена молекулярно-генетическая методология, включающая использование мультиплексных ПЦР-тест-систем в режиме реального времени для верификации Chl. pneumoniae и Ch. trachomatis, плазмидных и бесплазмидных штаммов Ch. trachomatis, а также генотипов Ch. trachomatis, что позволило выявить естественную системную хламидийную инфекцию у низших обезьян. Впервые выявлена зависимость выраженности патологического процесса и клинических проявлений от наличия и сочетания отдельных патогенетических факторов (плазмиды, функционального состояния гена IncA, принадлежности штамма хламидий к конкретному генотипу, одновременного инфицирования штаммами хламидий с разными генотипами).

Теоретическая значимость работы

Научно обоснована и подтверждена концепция о том, что взаимодействие микробиоценозов слизистых открытых полостей макроорганизма носит динамический характер, обеспечивает жизненно необходимый оптимальный уровень реактивности макроорганизма и его антиинфекционную резистеность. Тем самым, достоверно подтверждена роль микроорганизмов в обучении защитных систем макроорганизма в онтогенезе. Изменение антиинфекционной резистентности к гетерологичным патогенам на организменном и местном уровнях определяется набором факторов патогенности микроорганизмов, являющихся неотъемлемой патогенетической характеристикой возбудителей инфекций, обусловливающей, в конечном счёте, прогноз и исход заболевания.

Расширены представления о механизме формирования запуска инфекционного процесса, который является следствием взаимодействия микроорганизмов биотопов слизистых и возбудителей инфекционных заболеваний с TL-рецепторами, уровень экспрессии которых взаимосвязан с выраженностью показателей местного иммунитета (секреторных иммуноглобулинов и цитокинов).

Предложены теоретические основы и разработаны критерии комплексной оценки состояния микроэкологии и гуморального иммунитета слизистых открытых полостей человека в норме и при инфекционной патологии.

Представленный в диссертации метод комплексной оценки позволяет диагностировать степень микроэкологических нарушений, выявить этиологический фактор и прогнозировать тяжесть течения инфекционного процесса, проводить эффективные лечебно-профилактические мероприятия с целью элиминации возбудителей инфекции и восстановления микроэкологии и колонизационной резистености экосистем слизистых открытых полостей.

Практическая значимость работы

Впервые представлен алгоритм функционирования КР слизистых как интегральной составляющей местной антиинфекционной резистентности и мукозального иммунитета в целом. Предложенный запатентованный способ оценки КР слизистых можно рассматривать как метод оценки их мукозального иммунитета. Регистрация показателей уровней TLR, цитокинов и Ig слизистых имеет диагностическое и прогностическое значение, а также позволяет судить об эрадикации патогена.

Предложен универсальный молекулярно-генетический подход оценки патогенетических механизмов инфекционного процесса на организменном уровне и с учётом факторов патогенности возбудителя заболевания.

Впервые обоснованы принципы бактериофаготерапии перитонитов, отягощённых присоединением нозокомиальных микрорганизмов.

При бронхитах пятикратное повышение уровней экспрессии генов TLR-2, TLR-4, TLR-3, TLR-8 и цитокинов IL-1, IL-8, INF-, TNF- свидетельствует об остром течении инфекционного процесса и хорошей местной антиинфекционной резистентности, а отсутствие повышения - о хроническом течении и нарушении местной антиинфекционной резистентности, что имеет диагностическое и прогностическое значение.

При УГХ выявление в соскобном материале из Ур уровней экспрессии генов TLR-2 более 14 ОЕ и TLR-4 более 10 ОЕ, а в соскобном материале из Цк TLR-2 более 19 ОЕ и TLR-4 более 14 ОЕ указывает на острый УГХ; выявление в соскобном материале из Ур уровней экспрессии генов TLR-2 не более 5 ОЕ и TLR-4 не более 5 ОЕ, а в соскобном материале из Цк TLR-2 не более 6 ОЕ и TLR-4 не более 9 ОЕ указывает на хронический УГХ или начало хронизации инфекционного процесса. Апробированный метод определения уровней экспрессии генов TLR с применением ПЦР в реальном времени с обратной транскрипцией, с использованием специфических праймеров может быть востребован при лабораторной верификации возбудителя УГХ как дополнительный лабораторный тест, уточняющий клинические формы и прогнозирующий исход заболевания.

Внедрение в практику результатов исследования

Результаты проведенных исследований послужили основой для создания двух

Новых медицинских технологий:

1. «Оценка микробиоценоза влагалища при акушерской и гинекологической патологии». Утверждена Минздравсоцразвитием: Разрешение на применение новой медицинской технологии. Серия АА. № 0001997. ФС № 2009/187 от 17.07.2009 г.

2. «Оптимизация методов лечения детей с вирусно-бактериальными инфекциями различной этиологии». Утверждена Минздравсоцразвитием: Разрешение на применение новой медицинской технологии. Серия АА. № 0000429. ФС № 2009/326 от 30.09.2009 г.

На основании проведенных исследований оформлено 14 патентов на изобретение:

1. Патент РФ «Способ оценки микробиоценоза влагалища» № 2249821 от 10.04.2005.

2. Патент РФ «Основа для выделения и культивирования микроорганизмов» № 2279469 от 10.07.2006 г.

3. Патент РФ «Способ определения защитного действия покрытия капсул для штамма Bifidobacterium adolescentis MC42 от содержимого желудка»№2322506 от 20.04.2008г.

4. Патент РФ «Способ диагностики хронического урогенитального хламидиоза» № 2327995 от 27.06.2008 г.

5. Патент РФ «Способ профилактики нозокомиального перитонита» № 2333005 от 10.09.2008 г.

6. Патент РФ «Способ прогнозирования дестабилизации микробиоценоза организма млекопитающего» № 2377311 от 27.12.2009 г.

7. Патент РФ «Препарат, содержащий стафилококковый бактериофаг в качестве препарата для лечения кандидоза» № 2377006 от 27.12.2009 г.

8. Патент РФ «Способ диагностики хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления» № 2385946 от 10.04.2010 г. (награжден Федеральной службой по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам Дипломами в номинации «100 лучших изобретений России»).

9. Патент РФ «Способ прогнозирования манифестной или стертой формы хламидийной инфекции человека или обезьян и набор для его осуществления» № 2385945 от 10.04.2010 г. (награжден Федеральной службой по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам Дипломами в номинации «100 лучших изобретений России»).

10. Патент РФ «Способ диагностики угрозы прерывания беременности» № 2390022 от 20.05.2010 г.

11. Патент РФ «Способ установления неспецифического противоинфекционного действия иммуномодулирующего иммунобиологического препарата» № 2394559 от 20.07.2010 г.

12. Патент РФ «Способ оценки микробиоценоза полости матки у женщин с полипами эндометрия в постменопаузальном периоде» № 2430365 от 27.09.2011 г.

13. Патент РФ «Способ лечения полипов цервикального канала» № 2426537 от 20.08.2011 г.

14. Патент РФ «Способ генотипирования Chlamydia trachomatis» № 2443782 от 27.02.2012 г.

Материалы диссертационного исследования включены в учебные пособия и пособия для врачей:

1. «Микроэкология и гуморальный иммунитет слизистых открытых полостей человека в норме и при патологических состояниях» (Астрахань-Москва, 2011, УМО- 42 от 30.01.08), рекомендованное Учебно-методическим объединением по медицинскому и фармацевтическому образованию вузов России в качестве учебного пособия для системы послевузовского профессионального образования врачей.

2. Учебное пособие «Клинико-лабораторная эффективность применения отечественного комбинированного пробиотика «Флорин Форте» в комплексном лечении детей с инфекционной респираторной патологией и при острых кишечных инфекциях» (Москва, 2010, утверждено деканом факультета усовершенствования врачей ГУ МОНИКИ им. М.Ф. Владимирского, профессором Б.В. Агафоновым, Протокол № 63 от 23.09.2010 г.).

3. Пособие для врачей «Роль инфекции в развитии патологии верхнего отдела дыхательных путей у детей» (Москва, 2010, утверждено проректором по учебной работе и международному сотрудничеству Российской медицинской академии последипломного образования член-корр. РАМН, профессором И.В. Поддубной, 06.06.2010 г.).

Основные положения, выносимые на защиту

  1. Изменения уровней микробиологических показателей, гуморальных факто-

ров микробиоценозов и активности TLR слизистых открытых полостей отражают патогенетические механизмы инфекционных заболеваний и могут быть диагностическими и прогностическими критериями динамики течения инфекционно-воспалительных процессов различной локализации.

  1. Выявление нарушений микроэкологии биотопов влагалища, кишечника и

ротоглотки у беременных женщин, в том числе, с нарушением течения гестационного процесса, определяет необходимость проведения коррекции дисбиотических состояний.

  1. Оценка показателей микробного пейзажа позволяет дифференцировать рас-

пространенный гнойный вторичный или послеоперационный перитонит, верифицировать возбудителей инфекции, корректировать и оценивать эффективность проводимой терапии, а также прогнозировать исход патологического процесса.

  1. Показана возможность влияния патогенов на формирование повышенной

чувствительности макроорганизма к гетерологичным возбудителям инфекционного процесса на местном и организменном уровне. Доказана связь генотипических и фенотипических свойств возбудителей с патогенетическими механизмами и особенностями клинического течения инфекционных заболеваний.

Апробация работы

Диссертация апробирована на заседании Учёного совета ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора, Протокол № 3 от 21 марта 2013 г.

Материалы исследования и основные положения работы доложены на XIII Российском Национальном Конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 3-7 апреля 2006 г.), на XIV Российском Национальном Конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 16-20 апреля 2007 г.), на XV Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 14-18 апреля 2008г.), IV международной конференции, посвященной 85-летию Санкт-Петербурского НИИЭМ имени Пастера и 120-летию Парижского института Пастера "Идеи Пастера в борьбе с инфекциями" (Санкт-Петербург, 2-4 июня 2008г.), Всероссийской научно-практической конференции «Современные представления об иммунокоррекции» (Пенза, 2-3 октября 2008г.), XVI Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 6-10 апреля 2009г.), Научно-практической конференции молодых ученых и специалистов «Биологическая безопастность в современном мире» (Оболенск, 21-22 апреля 2009г.), The 3rd Congress of European Microbiologists «Microbes and Man - interdependence and future challenges» (Gothenburg, Sweden, June 28-July 2, 2009), XVIII Российском национальном конгрессе «Человек и лекарство» (Москва, 11-15 апреля 2011г.).

Публикации

По материалам диссертации опубликовано 86 печатных работ, в том числе 43 - в рецензируемых изданиях; 6 - в периодических изданиях; 15 - в сборниках материалов конференций; 3 книги в соавторстве; 2 новые медицинские технологии; 1 учебное пособие для системы послевузовского профессионального образования врачей, 2 пособия для врачей. Получены 14 патентов на изобретение РФ: № 2249821 от 10.04.2005, № 2327995 от 27.06.2008, № 2385945 от 10.04.2010, № 2385946 от 10.04.2010, № 2443782 от 27.02.2012, № 2390022 от 20.05.2010, № 2333005 от 10.09.2008, № 2394559 от 20.07.2010, № 2377311 от 27.12.2009, № 2377006 от 27.12.2009, № 2430365 от 27.09.2011, № 2426537 от 20.08.2011, № 2279469 от 10.07.2006, № 2322506 от 20.04.2008.

Объём и структура и диссертации

Диссертация изложена на 364 страницах печатного текста и состоит из следующих разделов: введения, обзора литературы, главы с описанием материалов и методов исследования, двух глав собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы, содержащего 540 источников, в том числе 234 отечественных и 306 зарубежных. Диссертация иллюстрирована 51 таблицей и 27 рисунками.

Показатели состояния микробиоценозов - показатели реактивности макроорганизма

Кожа, респираторный, урогенитальный и желудочно-кишечный тракт, конъюнктива глаза, слизистая ротовой полости, постоянно подвергающиеся воздействию разнообразных чужеродных веществ и микроорганизмов, выполняют собственную барьерную функцию. Барьерная функция этих областей определяется состоянием КР, под которой подразумевается способность микрофлоры и макроорганизма в кооперации защищать экосистему слизистых от патогенных микроорганизмов. Слизистые открытых полостей макроорганизма представляют собой единую систему [16, 69, 71, 89, 99, 173]. Колонизационная резистеность (КР) - физиологический феномен, направленный на поддержание микроэкологического гомеостаза и обеспечивается передаваемыми по наследству достаточно многочисленными механизмами. Является проявлением неспецифической антимикробной резистентности макроорганизма - одно из проявлений общей физиологической реактивности макроорганизма, его реакции на своеобразный раздражитель -микробный агент. Противомикробная резистентность сугубо индивидуальна, ее уровень определяется генотипом организма, возрастом, условиями жизни и труда и т. д. Состояние динамического равновесия между организмом хозяина, микроорганизмами его заселяющими и окружающей средой принято называть «эубиоз», при котором здоровье человека находится на оптимальном уровне. КР включает комплекс местных факторов, к которым принадлежат ингибиторы микроб-ной адгезии, биоцидные и биостатические продукты секретов, нормальная микрофлора, механические факторы (мерцательный эпителий, целостность кожи и слизистых), Ат [5, 58, 80, 172, 238, 260, 321, 329, 351, 414]. К механизмам феномена КР относятся кожа и слизистые оболочки (формируют физический и экологический барьер для проникновения патологических агентов внутрь организма), движение мукоцилиарного эпителия, перистальтику кишечника, десквамацию мукозных клеток, антимикробный эффект секретов слюны, желчи, желудочного и кишечного содержимого, состав и количество муцина, напряженность кислорода по толщине биопленки, рН среды, скорость обновления мукозного эпителия, местные иммунологические механизмы защиты.

Молекулярная эволюция эпителия слизистых проходила под давлением отбора, который способствовал уменьшению ответа организма на бактерии-комменсалы, при поддержании способности ответа на патогенные микроорганизмы. Иными словами, взаимоотношения между нормальной микрофлорой и слизистыми можно объяснить как результат конвергентной эволюции TL-рецепторов и поверхностных молекул микроорганизмов и эпителиоцитов. Очевидно, что у микроорганизмов в ходе эволюции сложилась система, позволяющая избегать направленного противомикробного действия защитных сил человеческого организма. Этим в определённой степени, объясняется способность индигенной микрофлоры избегать контролирующего механизма КР слизистых и быть слабо иммуногенной для хозяина. Экспрессия этих рецепторов может усиливаться в ответ на медиаторы воспаления [237]. Индигенная микрофлора играет важнейшую роль в обеспечении КР биотопов. Защитные её функции состоят в экранировании рецепторов от адгезинов посторонних микроорганизмов, конкуренции с последними за пищевые субстраты, стимуляции подвижности эпителия слизистых и процессов его обновления, продукции биологически активных соединений, в том числе антибиотикосхожих субстанций, детоксикации ксенобиотиков (в том числе микробного происхождения) за счет их абсорбции или биотрасформации, индукции иммунного ответа, имеющего перекрестную реакцию в отношении патогенных микроорганизмов, продукции неспецифических стимуляторов иммуногенеза и активаторов фагоцитарной и ферментатив 33 ной активности. Поддержание КР макроорганизма со стороны нормальной микрофлоры является многофакторным процессом. Важным фактором поддержания баланса в экосистеме микрофлора-макроорганизм является адгезия, посредством которой организм контролирует численность бактерий [87, 124]. В настоящее время цитадгезия рассматривается не только как начальный этап в патогенезе инфекционного процесса в ответ на большинство патогенных и условно-патогенных микроорганизмов (УПМ), но и как общебиологическое свойство, с помощью которого микроорганизмы колонизируют слизистые. Все микроорганизмы обладают выраженной способностью прикрепляться к органическим и неорганическим поверхностям. Естественный образ жизни большинства микроорганизмов связан с их закреплением на каких либо субстратах. Среди множества факторов, приносящих очевидную выгоду прикрепления, выделяются [40]: прикрепление к субстрату, как правило, обеспечивающее более выгодные условия доступа к питательным веществам; прикрепленные бактерии гораздо легче, чем свободноплавающие, образуют кооперативные структуры с другими видами; прикрепление и последующее размножение микроорганизмов с образованием микроколоний и/или пленки обеспечивает им более выгодные условия существования, связанные, в частности, с противодействием механическому удалению бактерий из макроорганизма; в прикрепленных бактериальных сообществах больше возможностей для обмена генетическим материалом (плазмидами), путь, по которому распространяется в том числе информация о детерминантах резистентности; на прикрепленные бактерии в меньшей степени воздействуют токсичные соединения, так как они диффундируют только с одной стороны, и нейтрализуются всем микробным сообществом, а не одиночной клеткой; для анаэробных форм расположение в глубоких слоях колоний (или тканях) - условие вегетирования. Прикрепление бактериальных клеток к поверхности это процесс, связанный как с физико-химическими взаимодействиями, так и с биологической активностью. Выделяют две группы механизмов адгезии - неспецифические и специфические. Неспецифическая адгезия, как правило, обратима. Для описания этого типа адгезии в англоязычной литературе иногда используют термин «docking» (постановка в док). Для описания специфической адгезии (взаимодействия с участием специальных молекул-адгезинов), которую считают необратимой, используют термин «anchoring» (за-якоревание). Для установления адгезионного контакта бактериальная клетка и клетка-мишень должны преодолеть электростатическое отталкивание, так как их поверхностные молекулы в норме несут отрицательный заряд. Сахаролити-ческие бактерии обладают необходимым ферментным аппаратом для отщепления отрицательно заряженных фрагментов. Возможны и гидрофобные адгезивные контакты между бактериями и эпителиоцитами слизистых. Адгезия микроорганизмов к поверхности эпителия слизистой может также осуществляться при помощи фимбрий, упорядоченно расположенных нитевидных выростов на поверхности бактериальных клеток. Однако наиболее важную роль играют взаимодействия между адгезинами и рецепторами эпителиоцитов слизистых, некоторые из которых являются видоспецифичными. Установление взаимодействия между патогеном и клеткой-мишенью в результате бактериальной адгезии является определяющим звеном в ходе инфекционного процесса. Молекулярный механизм бактериальной адгезии является универсальным для патогенных и комменсальных форм, что подтверждено на примере микрофлоры верхних дыхательных путей, нижних отделов пищеварительного и мочеполового трактов [472]. Доказано, что адгезивность микроорганизмов часто коррелирует с их патогенностью и вирулентностью [152, 254, 517]. In vivo на процесс адгезии существенное влияние оказывают растворенные компоненты биологических жидкостей и секретов, с которыми патогены чаще встречаются до контактов с клетками-мишенями и которые по химическому строению аналогичны клеточным рецепторам. Е. coli адгезируют к муцину слюны раньше, чем к эпителию ротовой полости [524]. Патологические изменения тканей макроорганизма создают дополнительные условия, способствующие адгезии микроорганизмов [42]. Нормальная аутофлора давно известна как антагонист бактерий, факультативных для той же экологической ниши, она препятствует адгезии и инвазии УПМ на слизистых оболочках и покровных тканях человека. Показано, что нормальная аэробная микрофлора кишечника снижает рецептивность энте-робактерий (патогенных и непатогенных штаммов Escherichia coli, Shigella spp.), уменьшая количество рецепторных мест для представителей транзитор-ной (факультативной) микрофлоры. Роль представителей комменсальной микрофлоры в регуляторной функции естественного микробиоценоза на стадии адгезии показана также на модели буккальных эпителиоцитов здоровых людей. Так, установлена относительная устойчивость эпителиоцитов к адгезии грамот-рицательных бацилл на фоне естественной колонизации эпителиальных клеток стрептококками (S. salivarius). Антагонистическая активность представителей индигенной микрофлоры человека является основополагающим фактором, обуславливающим КР и естественную устойчивость организма к патогенным микробам [87,124, 220, 514]. Благотворные эффекты нормальной микрофлоры включают предотвращение колонизации и инфекции благодаря конкуренции с патогенными микроорганизмами за пространство и питательные вещества. Нормальная резидентная микрофлора посредством низкомолекулярных метаболитов, а также специальных антимикробных веществ подавляет жизнедеятельность ряда патогенных микроорганизмов.

Роль врождённого иммунитета в инфекционной патологии

Одной из наиболее частых причин невынашивания беременности является УГИ, которая вызывает большой процент осложнений (гестоз, угроза прерывания беременности, многоводие, пиелонефрит беременных, плацентарная недостаточность), ВУИ плода и новорожденного [37, 97, 111]. В последнее десятилетие отмечается существенное изменение как спектра основных возбудителей УГИ, так и характера течения инфекционного процесса. Большую роль в развитии инфекций Вл играют УПМ [37, 87, 111, 204]. Причиной невынашивания беременности могут быть как экзогенные, так и эндогенные микроорганизмы, являющиеся нормальными представителями микрофлоры Вл [37, 87, 111]. Среди микробов, проникающих в полость матки из нижерасположенных отделов репродуктивного тракта, явно превалируют УПМ, а дисбаланс среды Вл рассматривается как основная причина осложненного течения беременности и ВУИ. В 40-65% случаев у беременных с высоким риском возникновения акушерской патологии регистрируются различные нарушения микроценоза Вл [37, 89, 198]. Наряду с первостепенной ролью нормальной микрофлоры, обеспечивающей КР биотопа Вл и предотвращения инфекционного заболевания, большое значение имеют локальные факторы противоинфекционной защиты, среди которых одним из основных являются Ig, препятствующие колонизации слизистых инфекционными агентами [70, 87, 111, 224]. Инфекционные процессы во Вл и шейке матки во время беременности в значительной степени можно снизить проведением скрининга на инфекции, своевременным выявлением нарушений равновесия различных видов микроорганизмов и проведения соответствующего лечения [87, 89, 190, 199].

Микробные экосистемы открытых полостей человека (Вл, ротоглотки и кишечника) находятся в состоянии постоянного взаимодействия [36, 83]. Состояние микрофлоры кишечника беременной существенно влияет на течение беременности и на процесс формирования кишечного биоценоза новорожденных [87]. Нарушения микробиоценоза кишечника коррелируют с изменениями в биотопе Вл. Акцентируюется внимание на коррекции нарушений микробиоценоза не только Вл, но также мочевого пузыря и кишечника беременных как на способе профилактики инфекционных заболеваний у родильниц и новорожденных [37, 68, 87]. Гормоны гестации нарушают микробное равновесие биоценозов всех слизистых оболочек беременной женщины. В глотке и кишечнике регистрируется избыточный бактериальный рост, развиваются кислая и бродильная диспепсии [106]. Длительный толстокишечный стаз при беременности приводит к активация УПМ, транслокация микробов и их токсинов через кишечную стенку, что является фактором риска, а в ряде случаев и непосредственной причиной осложнений беременности, родов и послеродового периода. Течение беременности на фоне толстокишечного стаза часто осложняется угрозой прерывания беременности, эндометритом [13, 36, 64]. В литературе отсутствуют данные о состоянии микробиоценоза и локального гуморального иммунитета кишечника у беременных с невынашиванием в I триместре гестации.

Изменения в полости рта нередко являются отражением закономерностей патогенеза ряда патологий, в первую очередь, со стороны системы пищеварительного тракта. Одним из наиболее информативных показателей функционального состояния полости рта является ее микрофлора. При синдроме раздраженной толстой кишки отмечены интенсивные сдвиги в микрофлоре полости рта с развитием дисбактериоза различной степени тяжести. При беременности на слизистой зева, носа, Вл и в моче имело место увеличение доли УПМ, а также появлением не свойственных исследуемым экологическим нишам микроорганизмов, а при выраженных дисбиотических нарушений полости рта и кишечника у женщин отмечена высокая частота осложнений беременности, родов и послеродового периода [83, 87, 219, 224].

Перитонит, его классификация, оценка тяжести, лечение- одни из самых насущных вопросов современной хирургии [60]. Воспаление (в том числе и воспаление брюшины- т.е. перитонит) - это реакция живой ткани на повреждение, заключающаяся в определенных изменениях терминального сосудистого ложа, крови, соединительной ткани, направленных на уничтожение агента, вызвавшего повреждение, и на восстановление поврежденной ткани [51, 130]. Наследственное или приобретенное несовершенство воспаления может приводить к индивидуальной дезадаптации вплоть до смерти [65].

В подавляющем большинстве случаев перитонит является полимикробным заболеванием, вызываемым возбудителями с различными патогенными свойствами [60, 143, 186]. Четко прослежена взаимосвязь между источником перитонита и доминирующей флорой, высеваемой из брюшной полости. В, желудке степень обсемененности- 0-103 КОЕ/мл, а в терминальном отделе подвздошной кишки 103-109 КОЕ/мл. Если источником перитонита явилась толстая кишка, то, более чем в 90% случаев определяется аэробно-анаэробная ассоциация микроорганизмов (чаще всего Е. coli и Bacteroides spp. или Clostridiae). Если источником инфицирования является желудок или тонкая кишка, то такая ассоциация встречается значительно реже, наравне с кишечной палочкой определяются и энтерококки, а из анаэробов- пептострептококки и пептококки. Степень обсемененности брюшной полости четко коррелирует с длительностью перитонита. [48, 60]. Исходный спектр микрофлоры перитонеального экссудата при вторичном перитоните, характеризуется стабильным единообразием и преобладанием высоковирулентных грамотрицательных микроорганизмов (эшерихии, клебсиеллы, псевдомонады, протей, стрептококки, стафилококки, энтеробактерии, бактероиды) [3].

Случаи длительно не разрешающегося перитонита и зачастую нерационального применения антибактериальных препаратов широкого спектра действия приводят к существенному изменению видового состава возбудителей перитонита, особенно его послеоперационных форм [47, 197].

Отсутствие положительной динамики в течение перитонита и условий для закрытия брюшной полости на протяжении 3-4 суток, часто заставляет прибегать к череде этапных санаций брюшной полости. При последующем микробиологическом исследовании перитонеального экссудата в ходе программируемых хирургических санаций брюшной полости практически у всех пациентов отмечается увеличение удельного веса госпитальной микрофлоры [49, 76], крайне высоко устойчивой к антибиотикам резерва [163].

Каждый конкретный стационар характеризуется своим микробным пейзажем, однако, в последнее десятилетие многие авторы указывают на преобладание неферментирующих микроорганизмов среди госпитальных штаммов (ацинетобактер и псевдомонады). За ними следуют клебсиеллы, эшерихии, энтерококки и бактероиды [3, 65, 170, 246]. Практически все нозокомиальные штаммы входят в состав нормальной микрофлоры кишечника человека. Именно поэтому УПМ следует рассматривать в качестве потенциального этиологического агента инфекционной болезни, если имеются экспериментальные и клинические данные, подтверждающие их патогенетическую роль в развитии патологического процесса. Важным аргументом также является наличие у микроорганизмов факторов вирулентности. При оценке значимости выделения УПМ у конкретных пациентов необходимо принимать во внимание такие факторы, как источник выделения, выделение в чистой культуре или в ассоциации с другими микроорганизмами, а также степень обсемененности клинического материала [3, 60, 149].

Клинико-лабораторная характеристика женщин с диагностированной уреаплазменной инфекцией урогенитального тракта

У детей с острым бронхитом естественная адгезия НЭ отличалась от таковой у БЭ при отсутствии корреляции между ними (р 0,001, г=0); адгезия Str. salivarius на НЭ отличалась от его адгезии на БЭ при слабой отрицательной корреляции между ними (р 0,007, г=-0,28); адгезия St. aureus на НЭ отличалась от его адгезии на БЭ при отсутствии корреляции между ними (р 0,02, г=0); адгезия К1. pneumoniae на НЭ отличалась от ее адгезии на БЭ при отсутствии корреляции между ними (р 0,001, г=0). У детей с хроническим бронхитом естественная адгезия НЭ отличалась от таковой БЭ при средней обратной корреляции между ними (р 0,001, г=-0,58); адгезия Str. salivarius на НЭ отличалась от его адгезии на БЭ при средней обратной корреляции между ними (р 0,002, г=-0,61); адгезия St. aureus на НЭ отличалась от его адгезии на БЭ при слабой обратной корреляции между ними (р 0,05, г=-0,25); адгезия К1. pneumoniae на НЭ не отличалась от ее адгезии на БЭ при слабой обратной корреляции между ними (р 0,1, г=-0,37). Следовательно, при нормальной обсемененности «оральными» стрептококками БЭ, обсемененность НЭ была также небольшой. У детей с бронхолегочными заболеваниями чем меньше бактерий было адгезировано на БЭ, тем их больше было адгезировано на НЭ, то есть у больных детей существует обратная зависимость между показателями естественной и искусственной адгезиями.

По сравнению с контрольной группой (таб.15) выявлено достоверное повышение концентрации slgA и sc (р 0,01), а также IgE, IgM и IgG (р 0,05) у больных с хроническим и острым бронхитами, однако достоверных различий между группами больных не выявлено.

При анализе местной продукции цитокинов (табл. 15) в группе детей с острым бронхитом отмечалось пятидесятикратное повышение IL-1J3 (р 0,001), десятикратное повышение IL-8 и TNF-a (р 0,001) и 4-5 кратное повышение INF-y и GM-CSF (р 0,001), а у детей с хроническим бронхитом отмечалось восьмикратное повышение IL-ip, IL-8 и TNF-a (р 0,05) и трехкратное повышение GM-CSF (р 0,05) по сравнению с контролем. При сопоставлении острого и хронического бронхитов достоверные различия (р 0,05) выявлены по уровням IL-ip и INF-y. Уровни IL-6, IL-9, IL-10, IL-12 практически не различалось во всех исследуемых группах. Соотношение ИФН-у/ИЛ-4 при остром бронхите составило 67,43±66,79, при хроническом бронхите- 13,45±3,35, у клинически здоровых детей- 46,27±49,05; между показателями выявлена достоверность различий при р 0,05.

При остром бронхите отсутствовала корреляционная связь между УПМ и TLR, УПМ и цитокинами. Регистрировалась слабая корреляционная связь между УПМ и IgM (г=0,37); средняя- между УПМ и альбумином (г=0,47), между УПМ и общим белком (г=0,49). Сильно коррелировали между собой показатели уровней экспрессии генов TLR-2 и TLR-3 (г=0,94), TLR-4 и TLR-8 (г=1,00), TLR-3 и TLR-8 (г=0,73). Показатели уровней экспрессии генов TLR-2 сильно коррелировали с высоким содержанием цитокина IL-ip (г=0,89), регистрировалась средняя корреляционная связь с INF-y (г=0,42). Выявлена средняя корреляционная зависимость между экспрессией генов TLR-4 и содержанием IL-8 (г=0,50). Показатели уровней экспрессии генов TLR-3 сильно коррелировали с высоким содержанием цитокина IL-1(3 (г=0,81). Выявлена средняя корреляционная зависимость между экспрессией генов TLR-8 и содержанием IL-8 (г=0,50). Следовательно, установлена корреляционная прямая зависимость между TLR и цитокинами. Не выявлено корреляционной зависимости между уровнями общего белка, альбумина, индексом ИЕКНЕ, IgE и TLR. Выявлены сильная корреляционная зависимость между уровнями альбумина и общего белка (г=0,99), средняя - между активностью лизоцима и уровнями IL-ip (г=0,44). Установлена сильная корреляционная связь между показателями уровней активности лизоцима и TLR-2 (r=0,73), TLR-4 (r=0,67), TLR-3 (г=0,72), TLR-8 (г=0,76), а также между уровнями slgA и TLR-2 (r=0,79), TLR-4 (г=0,76), TLR-3 (г=0,60), TLR-8 (г=0,66); средняя - между уровнями IgM и TLR-2 (r=0,52), TLR-4 (г=0,43), а также слабая - между уровнями IgM и TLR-3 (г=0,34), TLR-8 (r=0,39). Выявлена корреляционная зависимость сильная- между IgG и slgA (г=0,70), средняя- между IgG и sc (г=0,42), между IgM и slgA (г=0,31). Установлена корреляционная зависимость уровней IgG: сильная - с уровнями IL-8 (г=0,66); средняя- с TNF-a (г=0,53). Установлена корреляционная зависимость уровней IgM: средняя - с INF-y (г=0,48); слабая - с GM-CSF (г=0,34). Установлена корреляционная зависимость уровней slgA: средняя - с IL-8 (г=0,44); слабая - с INF-y (г=0,35). Установлена средняя корреляционная связь между уровнями sc и TNF-a (г=0,51). Не регистрировалось увеличения альбумина в слюне при наличии сильной корреляционной связи с общим белком, что указывало на местный синтез гуморальных мукозальных компонентов слюны. Таким образом, при остром бронхите в ответ на достоверно высокую инфекционную нагрузку (в виде микстинфекции вирусными патогенами и УПМ) повышаются уровни экспрессии генов TLR-2, TLR-4, TLR-3 и TLR-8, запускающие в верхних дыхательных путях продукцию провоспалительных цитокинов IL-8, TNF-a и IL-1Р, приводящих, в свою очередь, к увеличению содержания Ig, что можно расценивать как выраженную местную воспалительную иммунологическую реакцию макроорганизма, отражающую остроту инфекционного процесса и способствующую локализации инфекционного процесса, а также к стимуляции продукции дополнительных цитокинов соседними неинфицированными клетками. В ротоглотке нарастание уровней IgG, IgM, IgA, slgA и sc обусловлено их синтезом in situ. Уровни экспрессии TLR прямо коррелируют с показателями уровней slgA и лизоцима, что свидетельствует о их взаимосвязи как компонентов КР, отражающих состояние врождённого иммунитета, и не коррелируют с повышенными показателями индекса ИЕКНЕ что свидетельствует о низкой адгезивной способности эпителия ротоглотки в отношениии УПМ. Всё вместе указывает на высокий уровень колонизационной резистентности как показателя мукозального иммунитета. Отсутствует связь между TLR и IgE.

Микробиоценоз влагалища и цервикального канала при урогенитальной хламидийной инфекции

У пациенток с начавшимся выкидышем (1-я группа) установлено достоверное (р 0,05) снижение в просветной и пристеночной области Вл бифидобактерий по сравнению со здоровыми беременными, частота выявления которых составляла 10,7% и 9,3%, соответственно, тогда как в группе контроля частота обнаружения бифидобактерий в просветной и пристеночной области Вл была в 2 раза выше и составляла 20% и 25%, соответственно. Интенсивность колонизации просветной и пристеночной областей бифидобакте-риями достигала в группе контроля 5,0±0,5 и 4,6±0,5 lg КОЕ/г, соответственно, а у пациенток с начавшимся выкидышем- 3,7±1,1 и 3,5±1,1 lg КОЕ/г, соответственно (р 0,05), в то же время у беременных с прервавшейся беременностью бифидобактерий не были выявлены. Лактобациллы являются главной, но не единственной составляющей индигенной «протективной» микрофлоры уроге-нитального тракта. Результаты ряда проведенных исследований указывает на то, что популяция бифидобактерий является интенсивной частью индигенной микрофлоры, и так же, как и популяция лактобактерий, они являются индикатором дисбиотических сдвигов в данной микроэкологической системе [ПО].

Таким образом, у беременных основной группы отмечено достоверное (р 0,05) снижение как частоты встречаемости, так и степени колонизации индигенной флоры по сравнению с группой здоровых беременных.

Анализ факультативной микрофлоры в обследованных группах показал, что на первом месте по частоте обнаружения представителей УПМ биотопа Вл у беременных с начавшимся выкидышем (1-я группа) были грибами рода Candida, анаэробные стрептококки (пептострептококки) и энтерококки. В просветной области частота выявления грибов рода Candida составляла 21,3% случаев при интенсивности колонизации 4,7±1,5 lg КОЕ/г; пептострептококков- 20,0% случаев при интенсивности колонизации 4,5±0,6 lg КОЕ/г; энтерококков- 20,0% случаев при интенсивности колонизации 4,0±0,4 lg КОЕ/г. В пристеночной области влагалища грибы рода Candida выявлены в 20,0% случаев (интенсивность колонизации 5,5±1,5 lg КОЕ/г); пептострептококки - в 21,3% случаев (интен сивность колонизации 4,7±0,6 lg КОЕ/г); энтерококки - в 24,0% случаев (интенсивность колонизации 4,0±0,4 lg КОЕ/г).

У пациенток группы контроля частота выявления как в просветной, так и в пристеночной области Вл грибов рода Candida, пептострептококков и энтерококков также находилась на высоком уровне, хотя интенсивность колонизации пептострептококков в просветной и пристеночной области была достоверно (р 0,05) ниже, чем у беременных П-й группы. В просветной области грибы рода Candida выявляли в 15,0% случаев (интенсивность колонизации 4,7±1,0 lg КОЕ/г); пептострептококки - у 15,0% обследованных (интенсивность колонизации 4,0±0,5 lg КОЕ/г); энтерококки - у 15,0% (интенсивность колонизации 3,5±0,4 lg КОЕ/г). В пристеночной области данные возбудители определяли в 15,0% случаев (интенсивность колонизации 4,7±1,0 lg КОЕ/г), в 15,0% случаев (интенсивность колонизации 5,0±0,5 lg КОЕ/г) и у 20,0% пациенток (интенсивность колонизации 4,7±0,4 lg КОЕ/г).

На втором месте по частоте обнаружения у пациенток 1-й группы находились золотистый, коагулазоотрицательный, эпидермальный стафилококки, а также кишечная палочка и а-гемолитический стрептококк. В просветной области частота встречаемости золотистого стафилококка составляла 12,0% случаев (интенсивность колонизации 5,2±0,4 lg КОЕ/г), коагулазоотрицательного стафилококка- 12,0% случаев (интенсивность колонизации 4,7±1,5 lg КОЕ/г), эпи-дермального стафилококка - 10,7% случаев (интенсивность колонизации 3,9±0,7 lg КОЕ/г), кишечной палочки - 12,0% случаев (интенсивность колонизации 3,9±0,7 lg КОЕ/г) и а-гемолитического стрептококка- 9,3% случаев (интенсивность колонизации 5,5±2,4 lg КОЕ/г). В пристеночной области Вл довольно часто обнаруживали а-гемолитический стрептококк в высокой концентрации (12,0% случаев при интенсивности колонизации 6,0±2,4 lg КОЕ/г), кишечную палочку (12,0% случаев при интенсивности колонизации 4,9±0,7 lg КОЕ/г) и коагулазоотрицательный стафилококк (у 9,3% пациенток при интенсивности колонизации 4,7±1,5 lg КОЕ/г).

Необходимо отметить, что у беременных с начавшимся выкидышем интенсивность колонизации золотистого стафилококка в просветной и пристеночной области была достоверно (р 0,05) выше, чем у беременных контрольной группы.

Установлено, что в контрольной группе выявляемый спектр УПМ был значительно меньше. Из перечисленных выше микроорганизмов выявляли только кишечную палочку, золотистый и эпидермальный стафилококки в низкой концентрации. В просветной области частота выявления кишечной палочки составляла 10,0% случаев при интенсивности колонизации 3,4±0,4 lg КОЕ/г, эпидермального стафилококка- 15,0% случаев при интенсивности колонизации 2,0±1,0 lg КОЕ/г, золотистого стафилококка- 5,0% случаев при интенсивности колонизации 3,7±0,2 lg КОЕ/г. В пристеночной области каждый из данных микроорганизмов высевался в 10,0% случаев при интенсивности колонизации 4,4±0,2 lg КОЕ/г; 2,0±1,0 lg КОЕ/г и 3,7±0,3 lg КОЕ/г, соответственно.

Частота выявления и интенсивность колонизации клебсиелл в просветной и пристеночной областях Вл в контрольной группе была ниже, чем у беременных с начавшимся выкидышем, составляя 5,0% и 5,0% против 6,7% и 5,3, соответственно. При этом интенсивность колонизации была 2,0±0,1 lg КОЕ/г в просветной области и 3,7±0,2 lg КОЕ/г в пристеночной области у здоровых беременных и 4,7±1,0 lg КОЕ/г; 4,5±1,2 lg КОЕ/г, соответственно у беременных 1-й группы (р 0,05).

У пациенток с прервавшейся беременностью (П-я группа) УПМ биотопа Вл была представлена пептострептококками, коагулазоотрицательными стафилококками, кишечной палочкой, грибами рода Candida и золотистым стафилококком, частота обнаружения которых (кроме грибов) была достоверно (р 0,05) выше, чем у беременных 1-й или контрольной групп.

Похожие диссертации на Роль микробиоценозов открытых полостей в формировании реактивности организма; диагностические критерии дисбиозов для оценки состояния здоровья человека