Введение к работе
Актуальность проблемы
Крупные международные исследования свидетельствуют, что от 50 до 80% ежегодно регистрируемых в мире диарейных заболеваний могут быть обусловлены вирусами, ведущее место среди которых принадлежит ротавирусам, вызывающим от 25 до 60% случаев острых кишечных инфекций (Roman E., 2003; Parashar U. et al., 2003; Feeney S.A. et al., 2006). От тяжелой ротавирусной диареи в мире ежегодно умирает до 2 млн. человек, большинство из которых составляют дети первых лет жизни (Bryce J. et al., 2005; Podewils L. et al., 2005; Parashar U. et al., 2006; Santosham M. et al., 2007). Ротавирусная инфекция распространена повсеместно и наносит существенный вред здоровью населения как развитых, так и развивающихся стран, обусловливая прямые и непрямые экономические затраты, оценивающиеся сотнями миллиардов долларов в год (Parashar U. et al., 2003; Fischer T. et al., 2007).
Регистрируемый в Российской Федерации в последние годы рост показателей заболеваемости острыми кишечными инфекциями установленной этиологии обусловлен ротавирусной инфекцией, уровень заболеваемости которой за период 1999-2009 гг. увеличился в 7 раз, а удельный вес в структуре острых кишечных инфекций - с 1,4% до 7,0% (Г.Г. Онищенко, 2010). Истинный уровень заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами выше официально регистрируемого, что объясняется недостаточным на сегодняшний день лабораторным обследованием больных острыми кишечными инфекциями, в том числе детей, на ротавирусы в различных регионах Российской Федерации (Повиличенко И. П., 2005; Мефодьев В.В., 2006; Новикова Н.А., 2007; Жираковская Е.В., 2007; Подколзин А.Т., 2008).
Установлено значительное генетическое разнообразие и изменчивость ротавирусов, географические и сезонные различия циркулирующих генотипов со сменой доминирующих и эпидемически значимых генотипов. В настоящее время идентифицировано 27 Р- и 15 G-генотипов ротавирусов группы А, из них 14 Р- и 10 G-генотипов вызывают острый гастроэнтерит у человека (Gentsch J., 2005; Banyai K. et al., 2007; Macedo C. et al., 2007; Le V. et al., 2008). Проведение мониторинга за циркуляцией ротавирусов разных [P]G-генотипов и знание антигенного спектра ротавирусов, распространенных на той или иной территории, необходимо для создания поливалентной вакцины и оценки уже разработанных вакцин (Santos N., 2005; Vesikari T. et al., 2006; Glass R., 2006; Parashar U., 2006; Dennehy P., 2008).
Проведенные к настоящему времени в нескольких регионах Российской Федерации исследования циркуляции генетических вариантов ротавирусов охватывали только госпитализированных городских жителей (Новикова Н.А., 2007; Жираковская Е.В., 2007; Подколзин А.Т., 2008) и не распространялись на амбулаторных пациентов и жителей сельских территорий. В Омском регионе на момент планирования настоящей работы эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности ротавирусной инфекции углубленно изучались рядом авторов лишь применительно к перинатальным центрам в аспекте внутрибольничной инфекции.
Цель исследования
Совершенствование системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в Омской области с учетом региональных особенностей.
Задачи исследования
-
Изучить этиологическую структуру и проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций в Омской области за период с 1993 по 2007 гг.
-
Изучить проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области за период с 1993 по 2007 гг. и определить территории риска, группы риска, время риска и факторы риска.
-
Изучить генетическое разнообразие ротавирусов, циркулирующих на территории Омской области.
-
Разработать предложения по оптимизации системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции с учетом региональных особенностей.
Научная новизна
В работе продемонстрирована ведущая роль ротавирусов группы А в этиологической структуре острых кишечных инфекций на территории Омской области, представлены новые данные о возрастных и социальных характеристиках поражаемых контингентов, выявлены различия внутригодовой динамики заболеваемости детского и взрослого населения. Проведено ранжирование административных территорий по уровню заболеваемости ротавирусной инфекцией, выявлены сельские районы со стабильно высоким уровнем заболеваемости и установлены причины, его определяющие. Впервые дана оценка роли ротавирусов в формировании вспышечной заболеваемости населения Омской области острыми кишечными инфекциями.
Установлены территориальные, сезонные и возрастные особенности циркуляции различных генотипов ротавирусов группы А в населении г. Омска и сельских районов Омской области. Выявлены штаммы ротавирусов группы А с уникальными геномными характеристиками.
Практическая значимость
На основании проведенных исследований были разработаны предложения по совершенствованию системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции для регионального уровня реализации, позволившие улучшить этиологическую расшифровку острых кишечных инфекций и совершенствовать профилактику ротавирусной инфекции.
По результатам исследований подготовлены:
- Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области : методические рекомендации МР 3.1.1.003-10, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 27.09.2010 г.;
- Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией в лечебно-профилактических учреждениях для новорожденных и детей первого года жизни : методические указания МУ 3.1.6.007-04, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 05.05.2004 г.;
«Комплексный план мероприятий по профилактике острых кишечных инфекций, иерсиниозов и вирусного гепатита А на территории Омской области на 2006-2010 гг.», утвержденный Постановлением санитарно-противоэпидемической комиссии Правительства Омской области № 4 от 05.12.2006 г.;
Постановление Главного государственного санитарного врача по Омской области № 7 от 25.05.2010 г. «О профилактике острых кишечных инфекций»;
«О дополнительных профилактических и противоэпидемических мероприятиях по ротавирусной инфекции», «О лабораторной диагностике ротавирусной инфекции», «О состоянии заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области в 2007 г. и мерах ее профилактики» - информационно-методические письма № 10564 от 15.12.2006 г., № 775 от 01.02.2007 г., № 3069 от 15.04.2008 г.
В GenBank зарегистрированы 82 нуклеотидные последовательности изолятов ротавирусов группы А, циркулировавших на территории Омской области в 2007-2008 гг.
Материалы исследования и разработанные на их основе региональные методические рекомендации используются в деятельности Управления Роспотребнадзора по Омской области, Федерального государственного учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области», в работе лечебно-профилактических учреждений, в учебно-педагогическом процессе кафедры эпидемиологии и кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии, Центра повышения квалификации и профессиональной переподготовки специалистов ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава».
Положения, выносимые на защиту:
1. Ротавирусы группы А являются ведущими возбудителями острых кишечных инфекций установленной этиологии на территории Омской области. Проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области имеют региональные особенности.
2. Циркулировавшие в регионе ротавирусы группы А характеризовались выраженной вариабельностью генотипов в многолетней динамике и в распределении по административным территориям и поражаемым контингентам населения.
3. Приоритетным направлением повышения эффективности эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в современных условиях следует рассматривать совершенствование подходов к организации и проведению микробиологического мониторинга популяции возбудителя инфекции.
Апробация работы
Диссертационная работа апробирована на совместном заседании проблемной комиссии «Гигиена, экология, эпидемиология, общественное здоровье и здравоохранение» и кафедр эпидемиологии, микробиологии, вирусологии и иммунологии, гигиены с курсом гигиены детей и подростков, медицинской экологии с курсами гигиены питания и радиационной гигиены, общественного здоровья и здравоохранения с курсами истории медицины и биомедицинской этики, медицины труда и профзаболеваний ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава» (2010).
Основные положения диссертации доложены и обсуждены на:
VII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения», посвященной 85-летию образования Государственной санитарно-эпидемиологической службы Российской Федерации, Омск, 2007;
26th Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID), Graz, Austria, 2008;
совместном заседании Омских отделений Национального научного медицинского общества гигиенистов и санитарных врачей и Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, Омск, 2008;
VIII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири», посвященной 70-летию медико-профилактического факультета Омской государственной медицинской академии, Омск, 2008;
конференциях и совещаниях специалистов здравоохранения регионального и муниципального уровней.
По теме диссертации опубликовано 12 научных работ, из них 2 - в изданиях, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией Министерства образования и науки Российской Федерации для публикаций основных положений диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук.
Структура и объем работы
Диссертация изложена на 176 страницах текста компьютерного набора, содержит введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, главу собственных исследований, заключение, выводы и практические рекомендации, иллюстрирована 12 таблицами и 42 диаграммами. Список литературы включает 69 источников на русском языке и 126 иностранных источников. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы Омской государственной медицинской академии, номер государственной регистрации 01.200402778.