Электронная библиотека диссертаций и авторефератов России
dslib.net
Библиотека диссертаций
Навигация
Каталог диссертаций России
Англоязычные диссертации
Диссертации бесплатно
Предстоящие защиты
Рецензии на автореферат
Отчисления авторам
Мой кабинет
Заказы: забрать, оплатить
Мой личный счет
Мой профиль
Мой авторский профиль
Подписки на рассылки



расширенный поиск

Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Мустафин Алмаз Тлемисович

Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла
<
Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла
>

Данный автореферат диссертации должен поступить в библиотеки в ближайшее время
Уведомить о поступлении

Диссертация - 480 руб., доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Автореферат - 240 руб., доставка 1-3 часа, с 10-19 (Московское время), кроме воскресенья

Мустафин Алмаз Тлемисович. Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла : ил РГБ ОД 61:85-1/538

Содержание к диссертации

Введение

Глава I. Современные представления о временной организации клеточного цикла 8

1.1. Основные экспериментальные данные

1.2. Феноменологические подходы к описанию вариабельности интермитотического времени 16

1.3. Представления о динамических моделях клеточного цикла и основные пути

стохастизации динамических систем 24

Иллюстрации 37

Глава 2. Математическая модель мембранного митотического осциллятора 43

2.1. Перекисное окисление липидов и клеточное деление

2.2. Основные реакции окисления липидов в биологических мембранах 45

2.3. Система кинетических уравнений перекисного окисления липидов 62

2.4. Современные представления о физической организации плазматической мембраны

2.5. Параметрический анализ митотического осциллятора 74

Иллюстрации 78

Глава 3. Флуктуации длительности клеточного циклав рамках динамической модели деления ' 88

3.1. Учет флуктуации в модели мембранного осциллятора

3.2. Результаты расчетов и обсуждение 93

3.3. Связь развиваемого подхода к описанию вариабельности с трактовками других моделей

Иллюстрации 99

Глава 4. Теоретические возможности синхронизации клеточных делений с точки зрения модели мембранного осциллятора 103

4.1. Проблема получения длительно существующих синхронных популяций клеток

4.2. Автосинхронизация 104

4.3. Синхронизация внешним

периодическим воздействием 112

Иллюстрации 118

Заключение 123

Литература 126

Основные экспериментальные данные

Жизненный цикл клетки принято подразделять на четыре фазы: G - фаза, следующая за митозом; s - фаза синтеза ДНК; Gp - премитотичеекая фаза; м - митоз. В настоящее время большинство исследователей считает, что наряду с делением, клетки могут также переходить з состояния покоя, в которых они могут пребывать, не делясь, достаточно долго, сохраняя при этом способность вернуться в цикл (см., например, \Ч] ). Этому соответствуют так называемые фазы покоя G и GQ2 (ИЛИ IL и R2 в обозначениях [40] ), в которые клетка может выйти после митоза, или после завершения синтеза ДНК.

Многочисленные эксперименты по кинетике пролиферации показывают, что в клеточных популяциях наблюдается значительная вариабельность длительности как всего клеточного цикла в целом, так и его отдельных фаз. Ширина разброса интермитотического времени сравнима со средним значением времени генерации. При детальных исследованиях в культуре клеток выяснилось, что даже в режиме клонирования, когда казалось бы все клетки есть потомки одной родоначальной, и все внешние условия уравнены, наблюдаются заметные флуктуации длительности цикла.

В настоящем параграфе будет дан обзор современных экспериментальных достижений в области изучения вариабельности клеточного цикла. Объем материала, посвященного этим проблемам, весьма велик, и мы ограничимся рассмотрением экспериментальных данных, полученных, во-первых, in vitro и, во-вторых, на клетках млекопитающих. Кроме того, как это будет видно ниже, сравнение различных экспериментов между собой возможно только после их дополнительной классификации. Поэтому везде, где это нужно и возможно, мы будем различать трансформированные и нетрансформированные клетки, а также популяции циклирующих клеток и клеток, стимулированных к пролиферации из состояния покоя.

В настоящее время существует ряд экспериментальных методик для исследования вариабельности времени клеточного цикла: микрокиносъемка, авторадиография, наблюдение кинетики десинхрониза-ции.

Перекисное окисление липидов и клеточное деление

В 1957 г. Уилбур с соавт. 84 ] обнаружит связь между содержанием перекисей липидов в тканях регенерирующей печени и скоростью размножения клеток. Было показано, что количество перекисей находится в обратной зависимости от интенсивности митозов. Дальнейший прогресс в изучении этого вопроса был связан с развитием представлений о роли антиоксидантов в регуляции свободно-радикального окисления липидов биологических мембран [iOJ. Бко-антиоксиданты - природные вещества, содержащиеся в мембранах и тормозящие свободнорадикалыюе окисление полиненасыщеннкх жирных кислот. Антиокислительная активность (АОА) липидов определяется как относительным количеством антиоксидантов, так их способностью к ингибированию радикальных цепей. Уровень АОА является одним из важнейших регуляторних показателей свободнорадикальных процессов в клетке, поэтому установление связи между АОА и клеточным делением дает КЛЕИ к пониманию роли перекиского окисления липидов (ПОЛ) в процессе пролиферации.

В IS55 г. Бурлаковой была предложена гипотеза о роли сво-боднорадикального окисления липидов мембран в регуляции клеточного.", деления [S,I2]. Согласно этой гипотезе продукты свободнора-дикального окисления липидов играют роль митотических ингибиторов, а биоантиоксиданты, реагирующие со свободными радикалами, выступают как стимуляторы размножения клеток. В основе такого предположения лежали следующие экспериментальные шкты.

Во-первых, было - показано, что в регенерирующих органах и при росте перевиваемых и ш-щупируемых опухолей скорость деления клеток изменялась в прямой зависимости от АОА и в обратной - от концентрации свободных радикалов [l,35J. Точно такая же зависимость была продемонстрирована в ходе действия ионизирующего излучения и ряда химических препаратов, а также при введении животным синтетических антпоксидантоБ [її,2,21,ю] . Во-вторых, суточньїіі ритм митозов соответствовал суточному ритму АОА липидов органов животных [3,ю].

Учет флуктуации в модели мембранного осциллятора

С точки зрения автоколебательных динамических моделей клеточного деления в распределение клеток по длительностям циклов вносят вклад по крайней мере три фактора:

1) гетерогенность клеточной популяции по средним значениям параметров митотических осцилляторов, т.е. уникальность особенностей настройки индивидуальных "клеточных часов" ;

2) влияние случайных возмущений на динамику осциллятора ;

3) нестационарность средних значений параметров осцилляторов.

Если принять во внимание только первый фактор, то получится так, что время цикла для каждой отдельно взятой клетки предетер-минировано от рождения, и вся вариабельность интермитотических времен зависит только от разброса клеток по параметрам, характеризующим скорость циклирования. Эта точка зрения соответствует идеологии " Gi_ t.ate" модели Кастора, описанной нами в гл. I. Подобный "статический" механизм вариабельности несомненно играет некоторую роль в явлении гетерогенности временных характеристик циклов деления, однако хорошо известно, что вариабельность не исчезает и при переходе к изучению распределения времен циклов в клонах. Б этой связи представляется более интересным изучить статистику времени клеточного цикла во втором случае, т.е. для совокупности идентичных клеток. Более того, мы можем рассматривать только одну -единственную клетку, или один митотический осциллятор в течение длительного промежутка времени вместо ансамбля одинаковых клеток в данный момент, если пренебрежем влиянием третьего фактора. Это всегда можно сделать для суспензионных культур или для культур при не слишком больших плотностях посадки, а также в системах типа проточного культиватора, когда влияние межклеточного взаимодействия за время порядка нескольких циклов незначительно.и, таким образом, средние значения параметров слабо зависят от времени. То же замечание относится и к старению культуры клеток. В таком случае функция распределения времени цикла эквивалентна функции распределения относительного числа клеток по временам генерации и является стационарной.

Проблема получения длительно существующих синхронных популяций клеток

Получение популяций клеток, синхронно делящихся в культуре или в организме, с давних пор было заветной мечтой исследователей, работающих в самых разных областях биологии и медицины, биохимии клеточного цикла, химиотерапии и т.п. Было сделано множество попыток синхронизовать размножение с помощью таких "бло-каторов" клеточного цикла, как гидроксимочевина, тимидин, колце-мид, отбор клеток в митозе. Однако все эти попытки столкнулись одной и той же трудностью: после устранения блока происходила десинхронизация клеточных циклов, обусловленная разбросом значений интермитотических времен. Реально удается проследить всего лишь два-три максимума на кривых кинетики меченых митозов предварительно синхронизованной культуры. Кроме того, применение полного блока в большинстве случаев оказывает токсическое воздействие на клетки из-за высокой необходимой концентрации вещес-тва-блокатора. Таким образом, возникает задача синхронизации цик-лирующих клеток и поддержания нужной степени синхронности в течение многих циклов деления. С точки зрения автоколебательных моделей регуляции клеточного цикла можно предложить два подхода к ее решению: осуществление автосинхронизации популяции за счет усиления обменных процессов между клетками; и получение синхронной культуры с помощью малых периодически изменяющихся внешних воздействий. Прежде, чем перейти к изложению этих двух подходов в рамках мембранной модели митотического осциллятора, сделаем некоторые пояснительные замечания.

Необходимо четко разграничить два совершенно различных определения слова "фаза" по отношению к клеточному циклу. В терминах теории колебаний фаза - это время, истекшее с момента прохождения изображающей точкой некоторой фиксированной точки предельного цикла в фазовом пространстве ведущих переменных. В силу периодичности фазу можно считать изменяющейся в интервале от О до Т0, где TQ -период цикла. Таким образом, любому значению фазы О Ф Т0 совершенно однозначно соответствует определенная точка предельного цикла в фазовом пространстве, и наоборот.

Похожие диссертации на Математическое моделирование вариабельности фаз клеточного цикла