Введение к работе
Актуальность работы. Гликопротеины представляют собой один из важнейших классов биополимеров. Биологические свойства гликопротеинов в значительной степени определяются их углеводными цепями. Так, углеводные цепи гликопротеинов играют важную роль в процессах дифференцировки и злокачественного перерождения тканей, во взаимодействиях группоспецифических гликопротеинов с антителами. В ряде случаев именно углеэодные цепи задает физико-химические свойства гликопротеинов. Это обстоятельство стимулирует особый интерес к роли углеводов в составе гликопротеинов. Вместе с тем, вопрос о пространственном строении углеводных цепей в составе гликопротеинов и гликопептидов остается открытым. Экспериментальные данные показывают, что присутствие углеводных цепей определенным образом влияет на конформационное состояние пептидного остова. Поэтому исследование роли углеводных цепей в пространственной организации гликопептидов и гликопротеинов представляется весьма важным и актуальным.
Цель работы состоит в исследовании методом теоретического конформационного анализа в приближении механической модели молекулы невалентігах взаимодействий с участием как 0-, так и N-cвязанных углеводных цепей, которые влияют на формирование конформа-ций пептидного остова гликопептидов, а также принципов пространственной организации группоспецифических и антифризных гликопротеинов.
Научная новизна и практическая ценность работы. Впервые проведен всесторонний анализ взаимодействий боковых углеводных цепей между собой и с пептидным остовом. Определены преимущественные конформации реальных гликопептидных фрагментов, выделенных из группоспецифических гликопротеинов. Предложена пространственная
модель груїшосиецифических гликопротеинов с внешней компактной углеводной оболочкой. Предложена пространственная структура ан-тифризных гликопротеинов, которая позволяет объяснить механизм функционирования этих важных объектов. Рассмотроно пространственное строение сайта N-гликозилирования в связи с вопросами биосинтеза гликопротеинов. Создана универсальная программа для расчета на ЭВМ конформаций сложных гликопептидов и гликопротеинов, которая существенно экономит расчетную процедуру.
Апробация работы. Основные результаты работы докладывались на УП Всесоюзной конференции по химии и биохимии углеводов (Пущине, 1982) и УШ Всесоюзной конференции по химии и биохимии углеводов (Тбилиси, 1987).
Список публикаций включает 4 наименования.
Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, шести глав, заключения и выводов. Работа изложена на 260 страницах машинописного текста, содержит 65 рисунков и 54 таблицы. Список цитируемой литературы включает 255 наименований.
Похожие диссертации на Изучение принципов пространственной организации гликопротеинов методом теоретического конформационного анализа
