Введение к работе
Актуальность проблемы. Медико-биологические исследования играют важнейшую роль в современной медицине, биологии и экологии, позволяя получать достоверную и полную информацию о биологических объектах. Однако процесс исследования этих объектов осложняется в виду их особых свойств, заставляющих тщательно подбирать экспериментальные группы, проводить комплексные исследования, уделять большое внимание интерпретации результатов и т. п. Дополнительные сложности вносятся разнообразием физических и физико-химических проявлений жизнедеятельности, приемов проведения исследований даже на одной и той же группе, технических средств, которые практически с одинаковым успехом могут быть применены при решении той или иной исследовательской задачи. Последнее обстоятельство особенно важно, так как большинство методов исследований являются инструментальными.
Практически реализация конкретного метода исследования биологических объектов, рассчитываемого обычно на изучение определенного проявления их жизнедеятельности, осуществляется в соответствии с более детальным описанием последовательности приемов выполнения исследования - методикой, в которой предусматриваются все возможные обстоятельства (факторы), решающим образом определяющие качество исследования.
Апализ направлений совершенствования известных методов исследования биообъектов (а, кроме них, разрабатываются новые методы, основанные на достижениях биологических наук и технических усовершенствований) показывает, что расширяется сфера применения этих методов и количество методик исследования, растет парк технических средств, увеличивается список исследуемых объектов. Сегодня специалисты самого разного профиля, связанные с проведением медико-биологических исследований, вынуждены пользоваться всей информацией по методам исследований, но использовать эту информацию в собственных, отличающихся от других интересах. Разобраться во всем этом разнообразии необычайно сложно не только молодому специалисту (будь то медицинский специалист, технический работник по эксплуатации медицинской техники, менеджер и т.п.), но и исследователю, имеющему большой опыт практической работы.
Для упрощения работы исследователя в различных областях медицины, биологии и экологии все чаще стали появляться специализирован-
ные информационно-справочные системы, в которых делается попытка "разложить" всю информацию, необходимую для организации исследования, в некоторую систему - базу данных. Однако большинство разрабатываемых информационно-справочных систем имеют узкую специализацию. Они не рассчитаны на расширение используемой базы данных, ее интеграцию с другими информационно-справочными системами, не могут полноценно функционировать в локальных вычислительных сетях. Они представляют собой обособленные, закрытые программные продукты, не отвечающие современным требованиям к программному обеспечению исследований.
Для преодоления вышеуказанных недостатков и выхода на качественно новый уровень в разработке информационно-справочных систем подобного класса необходимо создание универсальной модели данных по методам медико-биологических исследований и связанным с ними аспектам, которая могла бы служить основой для создания разнообразных информационно-справочных систем, автоматизированных рабочих мест и баз данных и перевода существующих систем на новый уровень, рассчитанный на современные серверные системы управления базами данных .
Пель диссертационной работы состоит в разработке универсальной модели данных по методам медико-биологических исследований и создании на ее основе прикладных информационно-справочных систем и автоматизированных рабочих мест специалистов разного профиля, связанных с проведением исследований в медицине, биологии и экологии.
Для достижения поставленной цели необходимо решить следующие основные задачи:
провести анализ состояния и областей применения информационно-справочных систем, включающих данные по методам медико-биологических исследований;
разработать концептуальную универсальную модель данных по методам медико-биологических исследований;
создать технологию проектирования баз данных многопользовательских информационно-справочных систем по методам медико-биологических исследований;
разработать физическую модель базы данных по методам медико-биологических исследований;
разработать варианты информационно-справочных систем по физиологическим и аналитическим методам медико-биологических исследований, ядром которых являлась бы разработанная модель данных.
Методы исследований. Исследования базировались на структурном системном анализе, методологиях концептуального (логического) моделирования, теории множеств, теории формальных языков и грамматик, технологиях разработки информационных систем. При разработке экспериментальных информационно-справочных систем использовались данные по методам функциональных и аналитических исследований, техническим средствам, расходным материалам, приемам исследований и видам биообъектов и другие данные, предоставленные СПб ГМУ им. И.П. Павлова или взятые из специальной медико-технической литературы.
Научные положения, выносимые на защиту:
-
При разработке баз данных по методам медико-биологических исследований необходимо использовать созданную технологию разработки баз данных информационно-справочных систем, основанную на взаимосвязанных методологиях формального описания предметной области, функционального моделирования, концептуального и физического моделирования данных. Данная технология учитывает специфику предметной области и позволяет в короткие сроки создавать базы данных и, при необходимости, осуществлять их реинжениринг (перепроектирование).
-
Базы данных по методам медико-биологических исследований целесообразно создавать на основе разработанной универсальной модели данных, которая может служить основой для разнообразных баз данных.
Новые научные результаты. В процессе выполнения исследований в рамках диссертационной работы были получены следующие научные результаты:
предложена универсальная концептуальная модель данных для информационно-справочных систем, в частности, по методам медико-биологических исследований, которая может служить платформой для создания разнообразных баз данных, легко конвертируется в физическую базу данных для любой системы управления базами данных и модифицируется;
разработана специализированная технология разработки баз данных этого типа, дающая возможность связать отдельные методологии разработки баз данных во взаимосвязанную единую цепочку, значительно сократить сроки разработки, при необходимости осуществить быстрое и с наименьшими затратами перепроектирование существующей системы (реинжениринг);
разработана методология формального описания рассматриваемой предметной области, что позволило формально описать имеющиеся не-
формальные знания, выделить объекты предметной области, которые должны быть реализованы в разрабатываемой базе данных и в самом начале этапа анализа заложить фундамент для дальнейшей разработки;
- предложены специализированные расширения методологии функ
ционального моделирования, позволившие разделить потоки данных
и запросов, а также преодолеть недостатки методологии для разработки
баз данных информационных систем рассматриваемого класса.
Практическую ценность работы составляют:
универсальная концептуальная и физическая модели данных по методам медико-биологических исследований, которые могут служить основой для разнообразных баз данных, а также могли бы стать корпоративным стандартом на структуру подобных хранилищ данных;
специализированная технология разработки баз данных для информационно-справочных систем, учитывающая специфику предметной области и позволяющая в короткие сроки создавать базы данных и, при необходимости, осуществлять их реинжениринг (перепроектирование);
информационно-справочные системы по методам функциональных и аналитических исследований (лабораторному анализу), в основу которых положена разработанная модель данных, которые пригодны как для практической работы врача (исследователя), так и для учебной работы при подготовке и переподготовке специалистов, связанных с применением методов медико-биологических исследований или участвующих в их использовании.
Апробация работы. Основные результаты работы докладывались и обсуждались на следующих конференциях и семинарах: вторая международная научная конференция "Ноология. Экология. Здоровье. Гуманизм" (Санкт-Петербург, 1998 г.), первая научная сессия аспирантов ГУАП (ГУАП, Санкт-Петербург, 1998 г.), четвертая Санкт-Петербургская международная конференция "Региональная информатика - 98" (Санкт-Петербург, 1998 г.), вторая научная сессия аспирантов ГУАП (ГУАП, Санкт-Петербург, 1999 г.), семинары на кафедре БМЭ и ОС СПб ТЭТУ.
Публикации. По теме диссертации опубликована одна монография и 3 печатные работы.
Структура и объем диссертации.
Диссертация состоит из введения, четырех глав, заключения, списка литературы, включающего 87 наименований и двух приложений. Основная часть работы изложена на 132 страницах машинописного текста. Работа содержит 22 рисунка и 3 таблицы.